一、學術專書

1.

2010.05

《方豪晚年論文輯》，臺北：輔仁大學出版社。

2.

2009.02

《我的圓舞曲：虞兆中校長口述歷史》，臺北：臺大出版中心。

3.

2007.02

《羅宗洛校長與臺大相關史料集》（與楊宗霖編校），臺北：臺大出版中心。

4.

2001.12

《方豪先生年譜》，臺北：國史館。

5.

1990.05

《中國海洋發展關鍵時地個案研究：古代篇》，臺北：大安。

6.

1986.01

《泉州與我國中古的海上交通：九世紀末－十五世紀初》，臺北：學生。

7.

1975

《唐宋元時代中國與東非之關係》，臺北：政治大學非洲研究計劃（國立政治大學非洲研究專刊之三）。

8.

1975

《唐宋元時代中國與非洲交通史料匯編》，政大非洲研究專刊之四。

二、編譯書

1.

1999

《歷史》，李東華等編著，臺北：三民書局。

2.

1994.12

譯〈一個十七世紀荷蘭家庭在臺灣的紀錄〉，《歷史月刊》 83，頁90-95。

三、期刊論文

1.

2010

李東華，〈從往來書信看傅斯年與夏鼐的關係：兩代學術領袖的相知與傳承〉，《古今論衡》22，審查中。

2.

2010.07

李東華，〈徘徊於中西文化及基督新、舊教的中心與邊陲——徐誠斌主教的志業與平生〉，《輔大歷史學報》25，出版中。

3.

2009.05

〈光復初期臺大文學院的轉折與奠基¾¾莊長恭與傅斯年校長時期（1948.6～1950.12）〉，《臺大文史哲學報》70，頁113-144。

4.

2006.12

〈光復初期(1945-50)的民族情感與省籍衝突：從臺灣大學的接收改制做觀察〉，《臺大文史哲學報》65，頁183-221。

5.

2005.12

〈從海洋發展史的觀點看「海洋文化」的內涵〉，《海洋文化學刊》創刊號，頁265-268。

6.

2005.12

〈從媽祖信仰與鄭和遠航看海洋文化的發展〉，《海洋文化學刊》創刊號，頁13-20。

7.

2005.12

〈論陸志鴻治校風格與臺大文學院（1946.8～1948.5）〉，《臺大歷史學報》36，頁267-315。

8.

2005.05

〈方豪教授與香港學界的交往及其影響（1950～80）〉，《臺大文史哲學報》62，頁321-346

9.

2004.06

〈方豪神父與民國天主教會〉，《臺大歷史學報》33，頁261-313。

10.

2001.09

〈記抗戰時期顧頡剛先生致方杰人師的兩封信〉，《中國歷史學會史學集刊》33，頁217-226。

11.

1997.12

〈方豪與現代中國史學研究的轉變〉，《臺大歷史學報》21，頁261-272。

12.

1996.11

〈勳績盡瘁，死而後已－傅孟真先生在臺大〉，《臺大歷史學報》20，頁129-161。

13.

1994.12

〈「本國歷史」共同必修科的未來展望－新共同必修科架構與通識教育要求下大學歷史課程的自處之道〉，《通識教育》1:4，頁107-113。

14.

1990.12

〈海洋中國與大陸中國－中國海洋發展關鍵時地研究引論〉，《國立臺灣大學歷史學系學報》15，頁275-296。

15.

1990.06

〈漢晉變局中的渤海沿岸地區－兼論多元體系下的中韓關係〉，《韓國學報》9，頁1-17。

16.

1986.03

〈《泉州與我國中古的海上交通》自序〉，《書目季刊》19:4，頁46-47。

17.

1985.12

〈方杰人 (豪) 先生年譜稿〉，《文史哲學報》34，頁295-366。

18.

1984.12

〈五代北宋時期泉州海上交通之發展〉，《國立臺灣大學歷史學系學報》10/11，頁1-44。

19.

1984.07

〈中華民國歷史學博士論文內容及方法之評析〉，《史學評論》8，頁121-149。

20.

1983.12

〈兩宋福建與高麗關係淺探〉，《韓國學報》3，頁67-77。

21.

1982.12

〈唐末泉州的興起及其背景〉，《國立臺灣大學歷史學系學報》9，頁123-151。

22.

1982.03

〈五代北宋以降泉州海外交通轉盛的原因〉，《食貨月刊》11:11/12，頁489-505。

23.

1981.12

〈宋室南遷與泉州地位之提昇〉，《史原》11，頁197-212。

24.

1979.05

〈漢隋間中國南海交通之演變〉，《中國歷史學會史學集刊》11，頁45-51。

25.

1978.09

〈漢書地理志載中印航海行程之再檢討〉，《史原》8，頁47-59。

26.

1977.06

〈印度洋與古代中非交通之開展〉，《食貨月刊》7:4，頁161-171。

四、會議論文

1.

2010.05

〈從方杰人師的學術生涯看其對中西交通史之研究〉，主題演講，發表於「第6 屆文化交流史暨方豪教授百年誕辰紀念：先驅、探索與創新」國際學術研討會（輔大歷史學系、中研院臺史所主辦，天主教輔仁大學）。

2.

2009.11

〈徘徊於中西文化及新、舊教的中心與邊陲：徐誠斌（1920-1973）主教的志業與平生〉（On the Centre of Sino-Western Culture and the edge of Protestantism and Catholicism: The Missionary and Life of Bishop HSU Chen-Ping Francis），主題演講，發表於「澳門在天主教東進中的作用與地位」學術研討會（澳門理工學院中西文化研究所主辦，澳門理工學院）。

3.

2009.10

〈荷印「華人美色甘」新探¾¾從《華人美色甘條例》看其內涵與性質〉，發表於「2009海洋史學術研討會」（中央研究院人文社會科學研究中心海洋史研究專題中心主辦，中研院近史所檔案館）。

4.

2009.05

〈徘徊於中西文化及新舊教的中心與邊陲——徐誠斌主教的志業與平生〉，發表於「第五屆文化交流史：中心與邊緣的互動」國際學術研討會（天主教輔仁大學歷史學系主辦，輔仁大學）。

5.

2008.12

〈兩宋海上貿易重心的轉移¾¾從廣州到泉州的變遷〉，發表於「緬懷韓振華先生暨南海學術研討會」（海南大學、中國南海研究院等主辦，海南省海口市）。（與楊宗霖合著）

6.

2008.11

〈閩臺海洋發展的斷裂與延續〉，發表於「海峽兩岸海洋文化論壇」（福建省海洋與漁業局、廈門大學主辦，廈門大學）。

7.

2008.08

〈什麼是海洋人文？〉，發表於「教育部顧問室97-100年海洋教育先導型計畫—海洋人文論壇暨工作坊」（教育部顧問室海洋教育先導型計畫辦公室主辦，國家台灣文學館）。

8.

2008.06

〈臺灣專業史學的傳承與轉折──從帝大到臺大（1928–1960）〉，發表於「橫看成嶺側成?──二十世紀中國史學之回眸」研討會（香港浸會大學近代史研究中心、香港中國近代史學會主辦，香港浸會大學）。

9.

2007.11

〈澎湖群島在近世中國海洋發展史上的地位—宏觀立場的一己觀察〉，發表於「澎湖研究第七屆學術研討會—海洋發展下的澎湖」（馬公：澎湖縣文化局、中研院臺史所主辦，澎湖縣文化局演講室）。

10.

2007.02

李東華，〈二二八事件中的臺灣大學〉，發表於「二二八事件六十週年學術研討會」（中研院臺史所、臺北市文化局主辦，中研院學術活動中心第一會議室）。

11.

2006.11

李東華，〈顧頡剛與傅斯年：民國史學領袖的分與合〉，發表於「復辦廈門大學國學研究院學術演講」（廈門大學國學研究院主辦，廈門大學）。

12.

2006.05

〈光復初期的民族情感與文化衝突：從臺灣大學的接收改制做觀察〉，發表於「第二屆文化交流史「跨文化的互動、衝突與融合」國際研討會」（輔仁大學歷史學系主辦，輔仁大學）。

13.

2005.11

〈羅香林與方豪——港臺學術交流一例〉，發表於「羅香林教授百年誕辰國際學術研討會」（香港大學主辦，香港大學）。

14.

2005.11

〈從海洋發展史的觀點看「海洋文化」的內涵〉，發表於「海洋文化論壇：什麼是海洋文化？」（國立臺灣海洋大學人文及教育中心主辦，海洋大學）。

15.

2005.06

〈從媽祖信仰與鄭和遠航看海洋文化的發展〉，主題演講，發表於「2005年海洋文化研討會」（國立臺灣海洋大學海洋文化研究中心主辦，海洋大學）。

16.

2002.12

〈方豪神父對中梵關鍵關係（1945－1952）轉折的貢獻〉，《中梵外交關係史國際學術研討會論文集》，臺北：輔仁大學，239-266。

17.

2000.10

〈擾攘與新機：唐宋之際福建地區的歷史發展〉，《轉變與定型：宋代社會文化史學術研討會論文集》，臺北：臺灣大學歷史學系，頁475-492。

18.

2000

〈從海洋中國觀點看兩岸關係的未來走向〉，《第十二屆歐洲華人學術研討會》，主題演講。

19.

1999.05

〈方豪的中西交通史研究〉，《七十年來中西交通史研究的回顧與展望——以輔仁大學為中心研討會論文集》，臺北：輔仁大學，頁61-76。

20.

1993.06

〈「中外關係史」相關科目教學的內容問題〉，《歷史學系課程教學研討會論文集》（上），臺北：政治大學歷史學系，頁317-325。

21.

1993.04

〈中國海洋發展史教學中有關宋代的一些問題〉，《宋史教學研討會論文集》，臺北：臺灣大學歷史學系，頁63-72。

22.

1992.06

〈懷援菴與亮塵，念覺明與杰人－略論民國以來國人的中外關係史研究〉，《民國以來國史研究的回顧與展望研討會論文集》，臺北：國立臺灣大學出版組，頁901-914。

23.

1990.05

〈六朝遞嬗時代的嶺南地區〉，發表於「第四屆中國海洋發展史國際研討會」（中央研究院中山社會科學研究所主辦，中研院）。

24.

1988.06

〈真臘風土記三種校注本之比較研究〉，《國際宋史研討會論文集》，臺北：中國文化大學，頁315-328。

五、論文集論文

1.

2010

〈荷印「華人美色甘」新探¾¾從《華人美色甘條例》看其內涵與性質〉，預定收錄於劉石吉編，《中國海洋發展史論文集（第十一輯）》，臺北：中研院人社中心，審查中。

2.

2010.01

〈臺灣專業史學的傳承與轉折──從帝大到臺大（1928–1960）〉（新增補），收錄於李金強主編，《世變中的史學》，桂林：廣西師範大學出版社，頁147-171。

3.

2008.12

〈澎湖群島在近世中國海洋發展史上的地位—宏觀立場的一己觀察〉，收錄於《澎湖研究第七屆學術研討會論文輯》，馬公：澎湖縣文化局，頁89-97。

4.

2007.12

〈二二八事件中的臺灣大學〉，收錄於許雪姬主編，《二二八事件60週年紀念論文集》，臺北：臺北市文化局、臺北二二八紀念館、中研院臺史所，頁173-197。

5.

2007.08

〈臺灣專業史學的傳承與演變：從帝大到臺大（1928-1960）〉，收錄於黃清連編，《結網三編》，臺北：稻香，頁323-353。

6.

2006.02

〈方豪及其《中西交通史》〉，收錄於倉修良主編，《中國史學名著評介》增訂第五卷，濟南：山東教育出版社，頁1-8。

7.

2004.10

〈海洋中國與大陸中國〉，收錄於陳義初主編，《第四屆河洛文化國際研討會論文集》，鄭州：大象出版社，頁807-835。

8.

2003.07

〈光復初期的臺大文學院（1945-1950）：羅宗洛接收時期〉，收錄於周樑楷編，《結網二編》，臺北：東大，頁455-493。

9.

1997.03

〈五代南漢的對外關係〉，收錄於張炎憲編，《中國海洋發展史論文集（第六輯）》，臺北：中央研究院中山社會科學研究所，頁45-69。

10.

1993.02

〈五代吳越的對外關係〉，收錄於張彬村、劉石吉編，《中國海洋發展史論文集（第五輯）》，臺北：中央研究院中山社會科學研究所，頁17-59。

11.

1988.12

〈秦漢變局中的南越國：嶺南地區對外發展史研究之一〉，收錄於張炎憲編，《中國海洋發展史論文集（第三輯）》，臺北：中央研究院三民主義研究所，頁315-342，

12.

1986.12

〈海上交通與古代福建地區的開發〉，收錄於中國海洋發展史編輯委員會編，《中國海洋發展史論文集（第二輯）》，臺北：中央研究院三民主義研究所，頁89-104，

13.

1984.12

〈宋元時代泉州海外交通的盛況〉，收錄於中國海洋發展史編輯委員會編，《中國海洋發展史論文集（第一輯）》，臺北：中央研究院三民主義研究所，頁1-40，

六、書評

1.

2001.07

〈前進福爾摩莎－十七世紀大航海年代的臺灣〉，《誠品好讀》7。

2.

2001.09

〈當中國稱霸海上〉，《誠品好讀》9。

3.

1976.10

〈評介有關古代中非交通的兩本書(China's Discovery of Africa及China and Africa in the Middle Ages)〉，《史原》7，頁217-222。

七、專題研究計畫

1.

2008

國科會97年專題研究計畫96-2411-H-030-009-MY2：《傅斯年與史料學派：實際內涵與運作研究》（新制多年期第2年）

2

2007

國科會96年專題研究計畫96-2411-H-030-009-MY1：《傅斯年與史料學派：實際內涵與運作研究》（新制多年期第1年）

3.

2006

國科會95年專題研究計畫95-2411-H-002-022-：《光復初期臺大文學院的轉折與奠基:莊長恭與傅斯年校長時期(1948.6～1950.12)》

4.

2004

國科會93年專題研究計畫93-2411-H-002-039：《變遷與傳承：光復初期的臺灣大學文學院（1945-1950）》

5.

2002

國科會91年專題研究計畫91-2411-H-002-097-：《傳教生涯與歷史研究：方豪神父的角色》

八、其他著作

1.

2009.09

〈從往來書信看傅斯年與夏鼐的關係：實際內涵與運作研究〉（96-2411-H-030-009-MY2，國科會兩年期計畫之完整報告）。

2.

2008.12

〈海洋文化導論課程規畫〉（教育部顧問室海洋教育先導型計畫辦公室委託）。

3.

2008.07

〈傅斯年與史料學派－實際運作之研究（一）〉（96-2411-H-030-009-MY2，國科會兩年期計畫之期中報告）。

4.

2007.09

〈平淡無奇的教育實踐者－－錢思亮〉，《臺灣教育人物誌Ⅱ》（臺北：教育資料館）。另收錄於錢純、錢煦、錢復編，《永恆的懷念：錢思亮先生百齡冥誕紀念文集》（臺北：八方出版社，2008.02），頁305-318。（與楊宗霖合著）

5.

2006.09.24

〈他這樣作臺大校長——臺大首任校長羅宗洛的抱負與風骨〉，《中國時報．時報科學與人文》。

6.

2003.02

〈臺大的開放校風與人文精神〉，《文訊》208，37-41。

7.

2002.11

〈二十年來臺灣中國史研究趨勢之我見〉，《中國歷史學會會訊》70/71，22-24。

8.

2000.01

〈歷史上第一個千禧年的中國〉，《幼獅月刊》。

9.

1995.06

〈方豪傳〉，國史館《國史擬傳》5，頁1-14。

10.

1992.09

〈五代吳越的金錢外交〉，《歷史月刊》9，頁20-22。

11.

1992

〈中國海洋發展史話〉，《臺大造船》5，頁8-20。

12.

1991.06

〈世紀末的轉變－宋元易代與明初蛻變〉，《聯合文學》1991：6，頁47-50。

13.

1991.06

〈試談中國上古史教學的一些問題〉，《人文與社會學科教學通訊》2：1，頁149-157。

14.

1988.09

〈史學與天主之間：方豪的志業與生平〉，《歷史月刊》8，頁30-36。

15.

1986

〈大學「中國通史」教育之我見〉，《臺大工訊》。

16.

1985.10

〈一九四九年以後中華民國歷史學研究的發展〉，《中國論壇》241，頁36-43。

17.

1985

〈傅孟真先生臺大七百日史料抄〉，《臺大青年》91，頁9-22。

九、近三年他類學術活動

1.

2010.06

〈從澎湖看中國海洋發展的進程〉，發表於「第三屆海洋史研習營」（中研院人社中心海洋史研究專題中心主辦，澎湖生活博物館）。

2.

2010.05

〈台灣專業史學的傳承與轉折(1928~1960)〉，臺北大學歷史學系學術演講。

3.

2009.11

〈轉折與奠基：光復初期的臺灣大學〉，發表於「從校史出發」系列演講（臺大校史館主辦，國立臺灣大學校史館）。

4.

2007.12

〈二二八事件中的臺灣大學〉，發表於「臺北二二八紀念館歷史講座」。

5.

2007.08

〈從五代的東南三國看近世中國海洋活動的開展〉，發表於「第二屆海洋史研習營」（中研院人社中心海洋史研究專題中心主辦，金門技術學院）。

6.

2007.08

〈光復初期的臺灣大學(1945-1950)－－從文學院所做的觀察〉，臺大歷史學系榮退演講。

7.

2007.03

〈近悅遠來—宋代的國際經貿關係與社會脈動〉（3月10日，為廣達文教基金會主辦，《東方可頌：宋代文化大觀教育展教師研習營》中之一場），臺北：故宮博物院。

十、近三年相關學術職務

1.

《臺大歷史學報》主編（2006-2007）

2.

《政大歷史學報》編輯委員

3.

《國史館學術學刊》編輯委員（至2008年底）

4.

《白沙歷史地理學報》編輯委員

5.

教育部科技顧問室海洋先導型計畫諮詢委員

6.

大學入學考試中心命題研究委員（歷史科）

7.

東吳大學客座講座教授（2008年2-6月）

8.

高教評鑑中心大學評鑑歷史系評鑑委員

9.

《臺北市志》卷八〈學藝志〉分卷主編

10.

《中華民國發展史‧文化發展》撰寫計畫召集人（和漢寶德教授共同主持）。